選擇保護柱的原則是:在滿足分析分離要求的前提下,盡可能的選擇較短的保護柱結構,對分離樣品有比較小的保留性的色譜填料。
在選擇保護柱之前首先要考慮的是樣品是否清潔。對于大部分分析工作來說,一支1cm長的保護柱便能提供充分的保護作用。但是,如果樣品非常不清潔,或工作中要經常更換保護柱,那么就應該選擇2cm或3cm長的保護柱。但是,隨著保護柱的加長,保留時間也會變長。
一般來說,保護柱填料的選擇是由分析柱的填料決定的,正常情況下可以選擇與分析柱一樣的色譜填料,但是,根據實際工作的需要,也可以不必與分析柱的填料完全匹配。
當滿足下列條件之一時就應該更換保護柱:
a、色譜柱的理論塔片數下降15%以上;
b、色譜柱柱前壓上升15%以上;
c、最難分離的物質對分辨率下降15%以上;
d、樣品進樣次數超過150次;
e、流動相通過1500倍的色譜柱體積。